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【提供北京专业空间转录组测序实验技术服务】

发布时间:2021-07-15 22:06:35  来源:分子生物微生物检测检验鉴定分析诊断实验外包代做技术服务公司医学科研动物病理实验大小鼠Morris水迷宫实验两侧海马脑室脑立体定位注射实验外包ad转基因阿尔茨海默症小鼠app/ps1双转基因小鼠db/d  浏览:   【】【】【

空间转录组测序是从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,从而解析单个组织切片中的所有mRNA,从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达。空间转录组测序实验技术服务在肿瘤研究、免疫研究、发育生物学、脑神经学、病理研究等方面极为重要。空间转录组测序可用于肿瘤微环境、肿瘤异质性、肿瘤发生发展、肿瘤浸润淋巴细胞的研究,在空间位置上研究肿瘤组织与癌旁组织的区别,肿瘤细胞侵润过程中肿瘤细胞的变化对正常细胞的影响,肿瘤转移的不同过程阶段等,空间位置的研究对于探索肿瘤的机制至关重要。

  • 病理学

    通过添加基因表达维度,得出形态学结论

  • 免疫学

    免疫细胞浸润、免疫细胞中的基因表达特征

  • 发育生物学

    发现组织背景中与形态形成有关的基因

  • 神经科学

    绘制大脑的各个细胞层、区分正常与患病的大脑解剖特征

  • 肿瘤学

    肿瘤微环境、肿瘤异质性、病程进展、癌症形态、肿瘤浸润淋巴细胞

1、对新鲜冷冻组织进行切片,并进行成像。

2、将组织切片放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上,并进行固定和透化(使细胞中的mRNA得到释放,并结合到相应的捕获探针上,从而获取基因表达信息)。

3、以捕获的RNA为模板进行cDNA合成和测序文库制备。

4、对制备好的文库进行测序。

5、数据可视化分析(确定哪些基因得到表达,基因表达量,以及这些基因的空间位置信息)。

10X GENOMICS空间转录组技术原理

10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域,每个捕获区域的大小为6.5×6.5mm,包含5000个被条形码标记的点(barcoded spots),每个点的直径为55 μm,点和点之间中心的距离为100 μm,并且每个点都有一个唯一的barcode序列

组织切片的细胞中会释放出mRNA,迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列,然后进行文库构建并进行测序。

最后,根据数据的条形码信息对数据进行分析,以确定哪些数据来自哪个位置,从而实现空间基因表达的可视化


空间转录组测序实验技术服务优势

完善的平台

具有冷冻切片机、超高分辨率显微镜、10x Genomics Visium等服务平台;

专业的实验团队 

具有医学、病理学、分子生物学等专业技术经验;

精湛的切片技术 

已进行多类型样本的组织切片及染色操作,均可达到后续实验操作标准;

高通量、高灵敏度及高分辨率的检测 

每个芯片点阵包含近5000个spots,每个spot可以检测几千个基因;

无偏的结果 

特殊UMI的设计,避免反转录偏好性造成的误差,降低偏倚性;

一站式的服务 

可提供组织切片、染色、组织透化、文库构建、测序到数据分析、结果可视化的一站式服务。



责任编辑:北京专业空间转录组测序实验技术服务
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